Eu utilizo muito o ttf-liberation, principalmente no terminal.
Fora isso, todo o resto parece bom pra mim.

Yskar, a interface em si não me incomoda muito (isto é, a aparência), mas algumas funcionalidades dela são um tanto desnecessárias ou bem retardadas.
Uma coisa que me incomoda muito no gerenciador de arquivos padrão do Unity é a impossibilidade de usar o botão direito do mouse para abrir um terminal na pasta que ele está. Não sei se é uma função escondida ou se não está presente mesmo, mas incomoda. Tem também a impossibilidade de clicar 2 vezes pausadamente para renomear arquivos e pastas, função essa adicionada na nova versão do Cinnamon.
Outra coisa que me incomoda além do spyware desnecessário da Amazon (que dá pra desinstalar e bloquear pelo Unity Tweak Tool) é o menu lateral e o modo que você organiza os ícones.
É uma coisa boba mas você primeiro precisa arrastar pra fora o ícone antes de posicionar da maneira desejada.
Fora isso só a posição dos botões da janela que me incomodam.